Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPS6KC1Q96S38 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPS6KC1Q96S38 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPS6KC1Q96S38 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPS6KC1Q96S38 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RPS6KC1Q96S38 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
RPS6KC1Q96S38 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPS6KC1Q96S38 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPS6KC1Q96S38 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPS6KC1Q96S38 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPS6KC1Q96S38 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPS6KC1Q96S38 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPS6KC1Q96S38 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPS6KC1Q96S38 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPS6KC1Q96S38 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPS6KC1Q96S38 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPS6KC1Q96S38 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPS6KC1Q96S38 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPS6KC1Q96S38 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPS6KC1Q96S38 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPS6KC1Q96S38 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPS6KC1Q96S38 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KC1Q96S38 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KC1Q96S38 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KC1Q96S38 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KC1Q96S38 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KC1Q96S38 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPS6KC1Q96S38 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPS6KC1Q96S38 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPS6KC1Q96S38 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPS6KC1Q96S38 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPS6KC1Q96S38 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPS6KC1Q96S38 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPS6KC1Q96S38 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RPS6KC1Q96S38 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPS6KC1Q96S38 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPS6KC1Q96S38 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPS6KC1Q96S38 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RPS6KC1Q96S38 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RPS6KC1Q96S38 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPS6KC1Q96S38 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms