Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC115Q96NT0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC115Q96NT0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC115Q96NT0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC115Q96NT0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC115Q96NT0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC115Q96NT0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC115Q96NT0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC115Q96NT0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC115Q96NT0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC115Q96NT0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC115Q96NT0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC115Q96NT0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC115Q96NT0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC115Q96NT0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC115Q96NT0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC115Q96NT0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC115Q96NT0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC115Q96NT0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC115Q96NT0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC115Q96NT0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC115Q96NT0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC115Q96NT0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC115Q96NT0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC115Q96NT0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC115Q96NT0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC115Q96NT0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC115Q96NT0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC115Q96NT0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms