Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCLT1Q96NL6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCLT1Q96NL6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCLT1Q96NL6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCLT1Q96NL6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCLT1Q96NL6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCLT1Q96NL6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCLT1Q96NL6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCLT1Q96NL6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCLT1Q96NL6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCLT1Q96NL6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCLT1Q96NL6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCLT1Q96NL6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCLT1Q96NL6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCLT1Q96NL6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCLT1Q96NL6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCLT1Q96NL6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SCLT1Q96NL6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCLT1Q96NL6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCLT1Q96NL6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SCLT1Q96NL6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCLT1Q96NL6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCLT1Q96NL6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCLT1Q96NL6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCLT1Q96NL6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCLT1Q96NL6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCLT1Q96NL6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCLT1Q96NL6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SCLT1Q96NL6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCLT1Q96NL6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCLT1Q96NL6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCLT1Q96NL6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCLT1Q96NL6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms