Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL15Q96M94 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL15Q96M94 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL15Q96M94 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL15Q96M94 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL15Q96M94 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL15Q96M94 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms