Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00479Q96M42 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00479Q96M42 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00479Q96M42 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00479Q96M42 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00479Q96M42 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00479Q96M42 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00479Q96M42 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00479Q96M42 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00479Q96M42 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00479Q96M42 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00479Q96M42 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00479Q96M42 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00479Q96M42 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00479Q96M42 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00479Q96M42 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00479Q96M42 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00479Q96M42 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms