Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC120Q96HB5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC120Q96HB5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC120Q96HB5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC120Q96HB5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC120Q96HB5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC120Q96HB5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC120Q96HB5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC120Q96HB5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC120Q96HB5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC120Q96HB5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC120Q96HB5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC120Q96HB5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC120Q96HB5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC120Q96HB5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC120Q96HB5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC120Q96HB5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC120Q96HB5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC120Q96HB5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC120Q96HB5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC120Q96HB5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC120Q96HB5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC120Q96HB5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC120Q96HB5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC120Q96HB5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC120Q96HB5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC120Q96HB5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC120Q96HB5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC120Q96HB5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC120Q96HB5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC120Q96HB5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC120Q96HB5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC120Q96HB5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC120Q96HB5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC120Q96HB5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC120Q96HB5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC120Q96HB5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC120Q96HB5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC120Q96HB5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC120Q96HB5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC120Q96HB5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC120Q96HB5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC120Q96HB5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms