Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA7

SDSL, Serine dehydratase-like, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSLQ96GA7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSLQ96GA7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSLQ96GA7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSLQ96GA7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSLQ96GA7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSLQ96GA7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSLQ96GA7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSLQ96GA7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSLQ96GA7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDSLQ96GA7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDSLQ96GA7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSLQ96GA7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSLQ96GA7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSLQ96GA7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDSLQ96GA7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDSLQ96GA7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSLQ96GA7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSLQ96GA7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSLQ96GA7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDSLQ96GA7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDSLQ96GA7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSLQ96GA7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSLQ96GA7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSLQ96GA7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDSLQ96GA7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms