Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SNX21Q969T3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SNX21Q969T3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SNX21Q969T3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SNX21Q969T3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SNX21Q969T3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
SNX21Q969T3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SNX21Q969T3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SNX21Q969T3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SNX21Q969T3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SNX21Q969T3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SNX21Q969T3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SNX21Q969T3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SNX21Q969T3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SNX21Q969T3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SNX21Q969T3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SNX21Q969T3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SNX21Q969T3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SNX21Q969T3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SNX21Q969T3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SNX21Q969T3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SNX21Q969T3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SNX21Q969T3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SNX21Q969T3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SNX21Q969T3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SNX21Q969T3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SNX21Q969T3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SNX21Q969T3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SNX21Q969T3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SNX21Q969T3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SNX21Q969T3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SNX21Q969T3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SNX21Q969T3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SNX21Q969T3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
SNX21Q969T3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SNX21Q969T3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SNX21Q969T3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SNX21Q969T3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SNX21Q969T3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SNX21Q969T3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SNX21Q969T3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SNX21Q969T3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SNX21Q969T3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SNX21Q969T3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SNX21Q969T3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SNX21Q969T3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SNX21Q969T3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SNX21Q969T3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
SNX21Q969T3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SNX21Q969T3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SNX21Q969T3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SNX21Q969T3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SNX21Q969T3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SNX21Q969T3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SNX21Q969T3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SNX21Q969T3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SNX21Q969T3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SNX21Q969T3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SNX21Q969T3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SNX21Q969T3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SNX21Q969T3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SNX21Q969T3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SNX21Q969T3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SNX21Q969T3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SNX21Q969T3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SNX21Q969T3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SNX21Q969T3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SNX21Q969T3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SNX21Q969T3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SNX21Q969T3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SNX21Q969T3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SNX21Q969T3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SNX21Q969T3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SNX21Q969T3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SNX21Q969T3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SNX21Q969T3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SNX21Q969T3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SNX21Q969T3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SNX21Q969T3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SNX21Q969T3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SNX21Q969T3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SNX21Q969T3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SNX21Q969T3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.9 ms