Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC4Q92889 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC4Q92889 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC4Q92889 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC4Q92889 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC4Q92889 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERCC4Q92889 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC4Q92889 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC4Q92889 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERCC4Q92889 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC4Q92889 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERCC4Q92889 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERCC4Q92889 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERCC4Q92889 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
ERCC4Q92889 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC4Q92889 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC4Q92889 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC4Q92889 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC4Q92889 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC4Q92889 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC4Q92889 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC4Q92889 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC4Q92889 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERCC4Q92889 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ERCC4Q92889 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC4Q92889 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC4Q92889 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC4Q92889 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC4Q92889 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC4Q92889 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC4Q92889 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC4Q92889 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC4Q92889 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC4Q92889 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC4Q92889 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC4Q92889 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC4Q92889 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERCC4Q92889 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERCC4Q92889 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC4Q92889 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC4Q92889 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC4Q92889 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC4Q92889 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERCC4Q92889 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ERCC4Q92889 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC4Q92889 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC4Q92889 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERCC4Q92889 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ERCC4Q92889 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC4Q92889 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC4Q92889 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ERCC4Q92889 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERCC4Q92889 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERCC4Q92889 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERCC4Q92889 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERCC4Q92889 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC4Q92889 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC4Q92889 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC4Q92889 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC4Q92889 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC4Q92889 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC4Q92889 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC4Q92889 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC4Q92889 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERCC4Q92889 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC4Q92889 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC4Q92889 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC4Q92889 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms