Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGCDQ92629 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGCDQ92629 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SGCDQ92629 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SGCDQ92629 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGCDQ92629 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCDQ92629 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGCDQ92629 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGCDQ92629 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGCDQ92629 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGCDQ92629 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCDQ92629 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SGCDQ92629 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCDQ92629 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGCDQ92629 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGCDQ92629 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms