Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCG3Q8WXD2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCG3Q8WXD2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCG3Q8WXD2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCG3Q8WXD2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCG3Q8WXD2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCG3Q8WXD2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCG3Q8WXD2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCG3Q8WXD2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCG3Q8WXD2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCG3Q8WXD2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCG3Q8WXD2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCG3Q8WXD2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms