Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
TRIM41Q8WV44 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.99
TRIM41Q8WV44 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
TRIM41Q8WV44 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
TRIM41Q8WV44 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
TRIM41Q8WV44 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
TRIM41Q8WV44 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
TRIM41Q8WV44 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
TRIM41Q8WV44 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.98
TRIM41Q8WV44 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
TRIM41Q8WV44 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
TRIM41Q8WV44 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC46.1■■■■■ 4.97
TRIM41Q8WV44 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC46.1■■■■■ 4.97
TRIM41Q8WV44 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
TRIM41Q8WV44 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
TRIM41Q8WV44 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC46.07■■■■■ 4.97
TRIM41Q8WV44 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
TRIM41Q8WV44 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
TRIM41Q8WV44 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC46.03■■■■■ 4.96
TRIM41Q8WV44 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
TRIM41Q8WV44 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC46.02■■■■■ 4.96
TRIM41Q8WV44 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC46■■■■■ 4.95
TRIM41Q8WV44 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
TRIM41Q8WV44 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
TRIM41Q8WV44 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC45.97■■■■■ 4.95
TRIM41Q8WV44 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
TRIM41Q8WV44 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
TRIM41Q8WV44 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC45.95■■■■■ 4.95
TRIM41Q8WV44 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
TRIM41Q8WV44 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
TRIM41Q8WV44 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
TRIM41Q8WV44 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
TRIM41Q8WV44 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
TRIM41Q8WV44 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
TRIM41Q8WV44 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC45.9■■■■■ 4.94
TRIM41Q8WV44 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC45.89■■■■■ 4.94
TRIM41Q8WV44 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
TRIM41Q8WV44 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
TRIM41Q8WV44 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
TRIM41Q8WV44 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
TRIM41Q8WV44 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
TRIM41Q8WV44 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.84■■■■■ 4.93
TRIM41Q8WV44 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.84■■■■■ 4.93
TRIM41Q8WV44 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
TRIM41Q8WV44 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
TRIM41Q8WV44 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
TRIM41Q8WV44 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
TRIM41Q8WV44 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
TRIM41Q8WV44 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
TRIM41Q8WV44 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
TRIM41Q8WV44 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC45.8■■■■■ 4.92
TRIM41Q8WV44 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
TRIM41Q8WV44 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
TRIM41Q8WV44 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC45.77■■■■■ 4.92
TRIM41Q8WV44 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
TRIM41Q8WV44 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
TRIM41Q8WV44 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
TRIM41Q8WV44 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
TRIM41Q8WV44 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
TRIM41Q8WV44 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
TRIM41Q8WV44 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.91
TRIM41Q8WV44 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC45.69■■■■■ 4.9
TRIM41Q8WV44 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
TRIM41Q8WV44 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
TRIM41Q8WV44 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
TRIM41Q8WV44 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
TRIM41Q8WV44 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
TRIM41Q8WV44 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
TRIM41Q8WV44 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
TRIM41Q8WV44 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC45.61■■■■■ 4.89
TRIM41Q8WV44 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
TRIM41Q8WV44 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
TRIM41Q8WV44 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC45.6■■■■■ 4.89
TRIM41Q8WV44 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
TRIM41Q8WV44 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
TRIM41Q8WV44 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
TRIM41Q8WV44 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.89
TRIM41Q8WV44 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
TRIM41Q8WV44 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
TRIM41Q8WV44 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
TRIM41Q8WV44 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
TRIM41Q8WV44 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
TRIM41Q8WV44 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
TRIM41Q8WV44 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
TRIM41Q8WV44 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
TRIM41Q8WV44 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
TRIM41Q8WV44 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
TRIM41Q8WV44 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
TRIM41Q8WV44 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
TRIM41Q8WV44 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
TRIM41Q8WV44 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
TRIM41Q8WV44 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
TRIM41Q8WV44 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
TRIM41Q8WV44 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
TRIM41Q8WV44 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
TRIM41Q8WV44 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
TRIM41Q8WV44 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
TRIM41Q8WV44 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
TRIM41Q8WV44 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
TRIM41Q8WV44 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms