Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC12Q8WUD4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC12Q8WUD4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC12Q8WUD4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC12Q8WUD4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC12Q8WUD4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC12Q8WUD4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC12Q8WUD4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC12Q8WUD4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC12Q8WUD4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC12Q8WUD4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC12Q8WUD4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC12Q8WUD4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC12Q8WUD4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC12Q8WUD4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC12Q8WUD4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC12Q8WUD4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC12Q8WUD4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC12Q8WUD4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC12Q8WUD4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC12Q8WUD4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC12Q8WUD4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC12Q8WUD4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC12Q8WUD4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC12Q8WUD4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC12Q8WUD4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC12Q8WUD4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC12Q8WUD4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC12Q8WUD4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC12Q8WUD4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC12Q8WUD4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC12Q8WUD4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC12Q8WUD4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC12Q8WUD4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC12Q8WUD4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC12Q8WUD4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC12Q8WUD4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC12Q8WUD4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC12Q8WUD4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC12Q8WUD4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC12Q8WUD4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC12Q8WUD4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.6 ms