Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU66

TSPEAR, Thrombospondin-type laminin G domain and EAR repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPEARQ8WU66 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPEARQ8WU66 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPEARQ8WU66 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPEARQ8WU66 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPEARQ8WU66 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPEARQ8WU66 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPEARQ8WU66 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPEARQ8WU66 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPEARQ8WU66 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPEARQ8WU66 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPEARQ8WU66 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPEARQ8WU66 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPEARQ8WU66 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPEARQ8WU66 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPEARQ8WU66 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPEARQ8WU66 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPEARQ8WU66 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPEARQ8WU66 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPEARQ8WU66 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPEARQ8WU66 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSPEARQ8WU66 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSPEARQ8WU66 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPEARQ8WU66 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPEARQ8WU66 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPEARQ8WU66 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPEARQ8WU66 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPEARQ8WU66 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPEARQ8WU66 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPEARQ8WU66 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPEARQ8WU66 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPEARQ8WU66 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPEARQ8WU66 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPEARQ8WU66 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPEARQ8WU66 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPEARQ8WU66 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPEARQ8WU66 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPEARQ8WU66 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPEARQ8WU66 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPEARQ8WU66 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPEARQ8WU66 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPEARQ8WU66 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPEARQ8WU66 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPEARQ8WU66 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPEARQ8WU66 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPEARQ8WU66 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPEARQ8WU66 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPEARQ8WU66 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPEARQ8WU66 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPEARQ8WU66 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPEARQ8WU66 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPEARQ8WU66 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPEARQ8WU66 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPEARQ8WU66 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPEARQ8WU66 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPEARQ8WU66 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPEARQ8WU66 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPEARQ8WU66 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPEARQ8WU66 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TSPEARQ8WU66 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSPEARQ8WU66 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPEARQ8WU66 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPEARQ8WU66 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPEARQ8WU66 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPEARQ8WU66 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPEARQ8WU66 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPEARQ8WU66 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPEARQ8WU66 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPEARQ8WU66 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPEARQ8WU66 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPEARQ8WU66 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPEARQ8WU66 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPEARQ8WU66 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPEARQ8WU66 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPEARQ8WU66 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPEARQ8WU66 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPEARQ8WU66 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPEARQ8WU66 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPEARQ8WU66 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPEARQ8WU66 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPEARQ8WU66 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPEARQ8WU66 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPEARQ8WU66 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms