Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DNERQ8NFT8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DNERQ8NFT8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DNERQ8NFT8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DNERQ8NFT8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DNERQ8NFT8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DNERQ8NFT8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DNERQ8NFT8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DNERQ8NFT8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DNERQ8NFT8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DNERQ8NFT8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
DNERQ8NFT8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DNERQ8NFT8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DNERQ8NFT8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DNERQ8NFT8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DNERQ8NFT8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DNERQ8NFT8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DNERQ8NFT8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
DNERQ8NFT8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DNERQ8NFT8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DNERQ8NFT8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DNERQ8NFT8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DNERQ8NFT8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DNERQ8NFT8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DNERQ8NFT8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DNERQ8NFT8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DNERQ8NFT8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DNERQ8NFT8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DNERQ8NFT8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DNERQ8NFT8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DNERQ8NFT8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DNERQ8NFT8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DNERQ8NFT8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DNERQ8NFT8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DNERQ8NFT8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DNERQ8NFT8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DNERQ8NFT8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DNERQ8NFT8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DNERQ8NFT8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DNERQ8NFT8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DNERQ8NFT8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DNERQ8NFT8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DNERQ8NFT8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DNERQ8NFT8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DNERQ8NFT8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
DNERQ8NFT8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DNERQ8NFT8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
DNERQ8NFT8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DNERQ8NFT8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DNERQ8NFT8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DNERQ8NFT8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DNERQ8NFT8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DNERQ8NFT8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
DNERQ8NFT8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DNERQ8NFT8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
DNERQ8NFT8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNERQ8NFT8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNERQ8NFT8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNERQ8NFT8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNERQ8NFT8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNERQ8NFT8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNERQ8NFT8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DNERQ8NFT8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms