Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PASD1Q8IV76 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PASD1Q8IV76 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PASD1Q8IV76 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PASD1Q8IV76 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PASD1Q8IV76 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PASD1Q8IV76 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PASD1Q8IV76 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PASD1Q8IV76 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PASD1Q8IV76 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PASD1Q8IV76 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PASD1Q8IV76 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PASD1Q8IV76 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PASD1Q8IV76 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PASD1Q8IV76 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PASD1Q8IV76 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PASD1Q8IV76 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PASD1Q8IV76 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PASD1Q8IV76 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PASD1Q8IV76 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PASD1Q8IV76 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PASD1Q8IV76 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PASD1Q8IV76 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PASD1Q8IV76 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PASD1Q8IV76 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PASD1Q8IV76 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PASD1Q8IV76 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PASD1Q8IV76 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PASD1Q8IV76 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PASD1Q8IV76 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PASD1Q8IV76 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PASD1Q8IV76 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PASD1Q8IV76 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PASD1Q8IV76 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PASD1Q8IV76 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PASD1Q8IV76 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PASD1Q8IV76 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PASD1Q8IV76 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PASD1Q8IV76 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PASD1Q8IV76 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PASD1Q8IV76 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PASD1Q8IV76 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms