Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PALB2Q86YC2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PALB2Q86YC2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PALB2Q86YC2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PALB2Q86YC2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PALB2Q86YC2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PALB2Q86YC2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PALB2Q86YC2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PALB2Q86YC2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PALB2Q86YC2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PALB2Q86YC2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PALB2Q86YC2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PALB2Q86YC2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PALB2Q86YC2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PALB2Q86YC2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PALB2Q86YC2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PALB2Q86YC2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PALB2Q86YC2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PALB2Q86YC2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PALB2Q86YC2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PALB2Q86YC2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PALB2Q86YC2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PALB2Q86YC2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PALB2Q86YC2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PALB2Q86YC2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PALB2Q86YC2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PALB2Q86YC2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PALB2Q86YC2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PALB2Q86YC2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PALB2Q86YC2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PALB2Q86YC2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALB2Q86YC2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALB2Q86YC2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PALB2Q86YC2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PALB2Q86YC2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALB2Q86YC2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PALB2Q86YC2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PALB2Q86YC2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PALB2Q86YC2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALB2Q86YC2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALB2Q86YC2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALB2Q86YC2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PALB2Q86YC2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PALB2Q86YC2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PALB2Q86YC2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PALB2Q86YC2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PALB2Q86YC2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PALB2Q86YC2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PALB2Q86YC2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PALB2Q86YC2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PALB2Q86YC2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PALB2Q86YC2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PALB2Q86YC2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PALB2Q86YC2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PALB2Q86YC2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PALB2Q86YC2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PALB2Q86YC2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PALB2Q86YC2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PALB2Q86YC2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PALB2Q86YC2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PALB2Q86YC2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PALB2Q86YC2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PALB2Q86YC2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PALB2Q86YC2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PALB2Q86YC2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms