Protein–RNA interactions for Protein: Q86XF0

DHFR2, Dihydrofolate reductase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHFR2Q86XF0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHFR2Q86XF0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHFR2Q86XF0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHFR2Q86XF0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHFR2Q86XF0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHFR2Q86XF0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DHFR2Q86XF0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHFR2Q86XF0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHFR2Q86XF0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHFR2Q86XF0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHFR2Q86XF0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHFR2Q86XF0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DHFR2Q86XF0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHFR2Q86XF0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHFR2Q86XF0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHFR2Q86XF0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHFR2Q86XF0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHFR2Q86XF0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHFR2Q86XF0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHFR2Q86XF0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHFR2Q86XF0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHFR2Q86XF0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHFR2Q86XF0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DHFR2Q86XF0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DHFR2Q86XF0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DHFR2Q86XF0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DHFR2Q86XF0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DHFR2Q86XF0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DHFR2Q86XF0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DHFR2Q86XF0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DHFR2Q86XF0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DHFR2Q86XF0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DHFR2Q86XF0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DHFR2Q86XF0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DHFR2Q86XF0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHFR2Q86XF0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHFR2Q86XF0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHFR2Q86XF0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DHFR2Q86XF0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHFR2Q86XF0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHFR2Q86XF0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHFR2Q86XF0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHFR2Q86XF0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHFR2Q86XF0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DHFR2Q86XF0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DHFR2Q86XF0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms