Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX32Q86XE0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX32Q86XE0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX32Q86XE0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX32Q86XE0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX32Q86XE0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX32Q86XE0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX32Q86XE0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX32Q86XE0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX32Q86XE0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX32Q86XE0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX32Q86XE0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX32Q86XE0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX32Q86XE0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX32Q86XE0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX32Q86XE0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX32Q86XE0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX32Q86XE0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX32Q86XE0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX32Q86XE0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX32Q86XE0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX32Q86XE0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX32Q86XE0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX32Q86XE0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX32Q86XE0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX32Q86XE0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX32Q86XE0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX32Q86XE0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX32Q86XE0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX32Q86XE0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX32Q86XE0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX32Q86XE0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX32Q86XE0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX32Q86XE0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX32Q86XE0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX32Q86XE0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX32Q86XE0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX32Q86XE0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX32Q86XE0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX32Q86XE0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX32Q86XE0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX32Q86XE0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX32Q86XE0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX32Q86XE0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX32Q86XE0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX32Q86XE0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX32Q86XE0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX32Q86XE0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX32Q86XE0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX32Q86XE0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX32Q86XE0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX32Q86XE0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX32Q86XE0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX32Q86XE0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX32Q86XE0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX32Q86XE0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX32Q86XE0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX32Q86XE0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX32Q86XE0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX32Q86XE0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX32Q86XE0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX32Q86XE0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms