Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms