Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALYREFQ86V81 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALYREFQ86V81 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALYREFQ86V81 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALYREFQ86V81 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALYREFQ86V81 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALYREFQ86V81 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALYREFQ86V81 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALYREFQ86V81 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALYREFQ86V81 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALYREFQ86V81 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALYREFQ86V81 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALYREFQ86V81 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALYREFQ86V81 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALYREFQ86V81 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALYREFQ86V81 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALYREFQ86V81 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALYREFQ86V81 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALYREFQ86V81 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALYREFQ86V81 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALYREFQ86V81 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALYREFQ86V81 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALYREFQ86V81 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALYREFQ86V81 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ALYREFQ86V81 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALYREFQ86V81 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALYREFQ86V81 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALYREFQ86V81 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALYREFQ86V81 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ALYREFQ86V81 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALYREFQ86V81 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ALYREFQ86V81 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALYREFQ86V81 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ALYREFQ86V81 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALYREFQ86V81 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALYREFQ86V81 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALYREFQ86V81 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALYREFQ86V81 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALYREFQ86V81 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALYREFQ86V81 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALYREFQ86V81 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALYREFQ86V81 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALYREFQ86V81 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALYREFQ86V81 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALYREFQ86V81 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALYREFQ86V81 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALYREFQ86V81 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALYREFQ86V81 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALYREFQ86V81 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALYREFQ86V81 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALYREFQ86V81 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALYREFQ86V81 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALYREFQ86V81 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALYREFQ86V81 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ALYREFQ86V81 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ALYREFQ86V81 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ALYREFQ86V81 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALYREFQ86V81 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALYREFQ86V81 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALYREFQ86V81 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ALYREFQ86V81 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALYREFQ86V81 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALYREFQ86V81 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ALYREFQ86V81 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALYREFQ86V81 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ALYREFQ86V81 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ALYREFQ86V81 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ALYREFQ86V81 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALYREFQ86V81 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALYREFQ86V81 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALYREFQ86V81 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ALYREFQ86V81 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALYREFQ86V81 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALYREFQ86V81 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ALYREFQ86V81 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALYREFQ86V81 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALYREFQ86V81 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALYREFQ86V81 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALYREFQ86V81 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ALYREFQ86V81 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALYREFQ86V81 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms