Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF5Q86SE9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF5Q86SE9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF5Q86SE9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF5Q86SE9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF5Q86SE9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF5Q86SE9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF5Q86SE9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCGF5Q86SE9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCGF5Q86SE9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCGF5Q86SE9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCGF5Q86SE9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF5Q86SE9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF5Q86SE9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCGF5Q86SE9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCGF5Q86SE9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCGF5Q86SE9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF5Q86SE9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF5Q86SE9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF5Q86SE9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF5Q86SE9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCGF5Q86SE9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PCGF5Q86SE9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCGF5Q86SE9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCGF5Q86SE9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF5Q86SE9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCGF5Q86SE9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF5Q86SE9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF5Q86SE9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF5Q86SE9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCGF5Q86SE9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCGF5Q86SE9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCGF5Q86SE9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCGF5Q86SE9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCGF5Q86SE9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCGF5Q86SE9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms