Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2R9

SSBP3-AS1, Putative uncharacterized protein SSBP3-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms