Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCXQ7RTU7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCXQ7RTU7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCXQ7RTU7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCXQ7RTU7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCXQ7RTU7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCXQ7RTU7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCXQ7RTU7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCXQ7RTU7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCXQ7RTU7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCXQ7RTU7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCXQ7RTU7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCXQ7RTU7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCXQ7RTU7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCXQ7RTU7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCXQ7RTU7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCXQ7RTU7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCXQ7RTU7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCXQ7RTU7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCXQ7RTU7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCXQ7RTU7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCXQ7RTU7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCXQ7RTU7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCXQ7RTU7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms