Protein–RNA interactions for Protein: Q7L273

KCTD9, BTB/POZ domain-containing protein KCTD9, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD9Q7L273 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD9Q7L273 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD9Q7L273 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCTD9Q7L273 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD9Q7L273 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms