Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00299Q6ZSB3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00299Q6ZSB3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00299Q6ZSB3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00299Q6ZSB3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00299Q6ZSB3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00299Q6ZSB3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00299Q6ZSB3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00299Q6ZSB3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC00299Q6ZSB3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00299Q6ZSB3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00299Q6ZSB3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00299Q6ZSB3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00299Q6ZSB3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00299Q6ZSB3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00299Q6ZSB3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00299Q6ZSB3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00299Q6ZSB3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00299Q6ZSB3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00299Q6ZSB3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00299Q6ZSB3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00299Q6ZSB3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00299Q6ZSB3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00299Q6ZSB3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00299Q6ZSB3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00299Q6ZSB3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00299Q6ZSB3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00299Q6ZSB3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00299Q6ZSB3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00299Q6ZSB3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00299Q6ZSB3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00299Q6ZSB3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00299Q6ZSB3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00299Q6ZSB3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00299Q6ZSB3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00299Q6ZSB3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00299Q6ZSB3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00299Q6ZSB3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00299Q6ZSB3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00299Q6ZSB3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00299Q6ZSB3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00299Q6ZSB3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00299Q6ZSB3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00299Q6ZSB3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00299Q6ZSB3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00299Q6ZSB3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00299Q6ZSB3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00299Q6ZSB3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00299Q6ZSB3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00299Q6ZSB3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00299Q6ZSB3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00299Q6ZSB3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00299Q6ZSB3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00299Q6ZSB3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00299Q6ZSB3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00299Q6ZSB3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00299Q6ZSB3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00299Q6ZSB3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00299Q6ZSB3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00299Q6ZSB3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00299Q6ZSB3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00299Q6ZSB3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00299Q6ZSB3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms