Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNW5

GDPGP1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPGP1Q6ZNW5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDPGP1Q6ZNW5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDPGP1Q6ZNW5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDPGP1Q6ZNW5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDPGP1Q6ZNW5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPGP1Q6ZNW5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
GDPGP1Q6ZNW5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPGP1Q6ZNW5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPGP1Q6ZNW5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms