Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN7

TOMM20L, TOMM20-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20LQ6UXN7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TOMM20LQ6UXN7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TOMM20LQ6UXN7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOMM20LQ6UXN7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TOMM20LQ6UXN7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOMM20LQ6UXN7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOMM20LQ6UXN7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms