Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI78

TMEM65, Transmembrane protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM65Q6PI78 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM65Q6PI78 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM65Q6PI78 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM65Q6PI78 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM65Q6PI78 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM65Q6PI78 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM65Q6PI78 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms