Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NEK5Q6P3R8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NEK5Q6P3R8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK5Q6P3R8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEK5Q6P3R8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK5Q6P3R8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK5Q6P3R8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK5Q6P3R8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK5Q6P3R8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK5Q6P3R8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK5Q6P3R8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK5Q6P3R8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK5Q6P3R8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NEK5Q6P3R8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK5Q6P3R8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK5Q6P3R8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NEK5Q6P3R8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NEK5Q6P3R8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK5Q6P3R8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK5Q6P3R8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK5Q6P3R8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms