Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MRNIPQ6NTE8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRNIPQ6NTE8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MRNIPQ6NTE8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRNIPQ6NTE8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRNIPQ6NTE8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRNIPQ6NTE8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRNIPQ6NTE8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MRNIPQ6NTE8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MRNIPQ6NTE8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MRNIPQ6NTE8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRNIPQ6NTE8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRNIPQ6NTE8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRNIPQ6NTE8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MRNIPQ6NTE8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRNIPQ6NTE8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRNIPQ6NTE8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRNIPQ6NTE8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRNIPQ6NTE8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRNIPQ6NTE8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRNIPQ6NTE8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms