Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRNP1Q6NT89 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRNP1Q6NT89 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRNP1Q6NT89 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRNP1Q6NT89 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRNP1Q6NT89 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRNP1Q6NT89 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRNP1Q6NT89 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRNP1Q6NT89 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRNP1Q6NT89 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRNP1Q6NT89 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRNP1Q6NT89 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRNP1Q6NT89 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRNP1Q6NT89 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRNP1Q6NT89 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms