Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHEQ5VZ18 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHEQ5VZ18 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHEQ5VZ18 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHEQ5VZ18 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHEQ5VZ18 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHEQ5VZ18 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHEQ5VZ18 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHEQ5VZ18 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHEQ5VZ18 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHEQ5VZ18 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHEQ5VZ18 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHEQ5VZ18 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHEQ5VZ18 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHEQ5VZ18 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHEQ5VZ18 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHEQ5VZ18 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHEQ5VZ18 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHEQ5VZ18 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHEQ5VZ18 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHEQ5VZ18 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHEQ5VZ18 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHEQ5VZ18 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHEQ5VZ18 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHEQ5VZ18 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SHEQ5VZ18 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHEQ5VZ18 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SHEQ5VZ18 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHEQ5VZ18 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHEQ5VZ18 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHEQ5VZ18 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHEQ5VZ18 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHEQ5VZ18 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHEQ5VZ18 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHEQ5VZ18 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHEQ5VZ18 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SHEQ5VZ18 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHEQ5VZ18 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHEQ5VZ18 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHEQ5VZ18 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms