Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QL3Q5VWW1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QL3Q5VWW1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QL3Q5VWW1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QL3Q5VWW1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QL3Q5VWW1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QL3Q5VWW1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QL3Q5VWW1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QL3Q5VWW1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QL3Q5VWW1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QL3Q5VWW1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QL3Q5VWW1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QL3Q5VWW1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QL3Q5VWW1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QL3Q5VWW1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QL3Q5VWW1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QL3Q5VWW1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QL3Q5VWW1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QL3Q5VWW1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QL3Q5VWW1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QL3Q5VWW1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QL3Q5VWW1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QL3Q5VWW1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QL3Q5VWW1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QL3Q5VWW1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QL3Q5VWW1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QL3Q5VWW1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QL3Q5VWW1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QL3Q5VWW1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QL3Q5VWW1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QL3Q5VWW1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QL3Q5VWW1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QL3Q5VWW1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QL3Q5VWW1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QL3Q5VWW1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QL3Q5VWW1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QL3Q5VWW1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QL3Q5VWW1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QL3Q5VWW1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1QL3Q5VWW1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1QL3Q5VWW1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QL3Q5VWW1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QL3Q5VWW1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QL3Q5VWW1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QL3Q5VWW1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QL3Q5VWW1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QL3Q5VWW1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QL3Q5VWW1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QL3Q5VWW1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QL3Q5VWW1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QL3Q5VWW1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QL3Q5VWW1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QL3Q5VWW1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QL3Q5VWW1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1QL3Q5VWW1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QL3Q5VWW1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms