Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PERM1Q5SV97 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PERM1Q5SV97 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PERM1Q5SV97 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PERM1Q5SV97 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PERM1Q5SV97 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PERM1Q5SV97 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PERM1Q5SV97 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PERM1Q5SV97 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PERM1Q5SV97 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PERM1Q5SV97 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PERM1Q5SV97 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PERM1Q5SV97 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PERM1Q5SV97 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PERM1Q5SV97 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PERM1Q5SV97 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PERM1Q5SV97 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PERM1Q5SV97 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PERM1Q5SV97 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PERM1Q5SV97 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PERM1Q5SV97 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PERM1Q5SV97 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PERM1Q5SV97 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PERM1Q5SV97 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PERM1Q5SV97 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PERM1Q5SV97 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PERM1Q5SV97 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PERM1Q5SV97 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PERM1Q5SV97 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PERM1Q5SV97 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PERM1Q5SV97 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PERM1Q5SV97 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PERM1Q5SV97 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PERM1Q5SV97 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PERM1Q5SV97 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms