Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH2D4BQ5SQS7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH2D4BQ5SQS7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH2D4BQ5SQS7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH2D4BQ5SQS7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH2D4BQ5SQS7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH2D4BQ5SQS7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH2D4BQ5SQS7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH2D4BQ5SQS7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2D4BQ5SQS7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH2D4BQ5SQS7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH2D4BQ5SQS7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH2D4BQ5SQS7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH2D4BQ5SQS7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH2D4BQ5SQS7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2D4BQ5SQS7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2D4BQ5SQS7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH2D4BQ5SQS7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2D4BQ5SQS7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2D4BQ5SQS7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SH2D4BQ5SQS7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2D4BQ5SQS7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D4BQ5SQS7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D4BQ5SQS7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D4BQ5SQS7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D4BQ5SQS7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4BQ5SQS7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4BQ5SQS7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2D4BQ5SQS7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH2D4BQ5SQS7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH2D4BQ5SQS7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms