Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms