Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PROX2Q3B8N5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PROX2Q3B8N5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PROX2Q3B8N5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PROX2Q3B8N5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PROX2Q3B8N5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PROX2Q3B8N5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PROX2Q3B8N5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PROX2Q3B8N5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PROX2Q3B8N5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PROX2Q3B8N5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PROX2Q3B8N5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PROX2Q3B8N5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PROX2Q3B8N5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROX2Q3B8N5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms