Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX9

C2orf68, UPF0561 protein C2orf68, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf68Q2NKX9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2orf68Q2NKX9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C2orf68Q2NKX9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2orf68Q2NKX9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf68Q2NKX9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2orf68Q2NKX9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2orf68Q2NKX9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf68Q2NKX9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf68Q2NKX9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms