Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.622e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 29.68□□□□□ -0.861e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.871e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.961e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.111e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 47.9□□□□□ -1.141e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.151e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 35.76□□□□□ -1.491e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 34.86□□□□□ -1.631e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 SLC43A1-202ENST00000524995 953 ntTSL 315.69■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 28.2
SRSF7Q16629 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 28.2
SRSF7Q16629 SLC43A1-207ENST00000533066 999 ntTSL 314.06□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 28.2
SRSF7Q16629 SLC43A1-210ENST00000534105 580 ntTSL 514.05□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 28.2
SRSF7Q16629 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 28.2
SRSF7Q16629 SLC43A1-206ENST00000530159 788 ntTSL 513.15□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 28.2
SRSF7Q16629 SLC43A1-203ENST00000525764 556 ntTSL 310.47□□□□□ -0.734e-7■■■■■ 28.2
SRSF7Q16629 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 28
SRSF7Q16629 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 28
SRSF7Q16629 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 28
SRSF7Q16629 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 28
SRSF7Q16629 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 28
SRSF7Q16629 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 28
SRSF7Q16629 GPBP1L1-202ENST00000355105 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 28
SRSF7Q16629 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 28
SRSF7Q16629 RERE-216ENST00000505225 533 ntTSL 25.3□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 28
SRSF7Q16629 GPBP1L1-206ENST00000479235 3121 ntTSL 24.78□□□□□ -1.642e-7■■■■■ 28
SRSF7Q16629 GPBP1L1-205ENST00000468724 559 ntTSL 34.15□□□□□ -1.752e-7■■■■■ 28
SRSF7Q16629 LINC01033-201ENST00000504609 735 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.031e-8■■■■■ 27.9
SRSF7Q16629 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.661e-8■■■■■ 27.9
SRSF7Q16629 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.39e-13■■■■■ 27.9
SRSF7Q16629 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.329e-13■■■■■ 27.9
SRSF7Q16629 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 29.77□□□□□ -0.849e-13■■■■■ 27.9
SRSF7Q16629 LRP3-202ENST00000590275 1078 ntTSL 216.69■□□□□ 0.261e-8■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.073e-16■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 215.37■□□□□ 0.053e-16■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 LRP3-204ENST00000592484 575 ntTSL 412.16□□□□□ -0.461e-8■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.823e-16■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.853e-16■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.863e-16■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.953e-16■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 27.5
SRSF7Q16629 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.742e-10■■■■■ 27.5
SRSF7Q16629 AC006001.2-203ENST00000428557 304 ntTSL 39.24□□□□□ -0.932e-10■■■■■ 27.5
SRSF7Q16629 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 27.5
SRSF7Q16629 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 27.4
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SRSF7Q16629 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.639e-9■■■■■ 27.3
SRSF7Q16629 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 27.1
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SRSF7Q16629 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 27.1
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SRSF7Q16629 PTPN4-207ENST00000460162 623 ntTSL 417.53■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 27
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SRSF7Q16629 PTPN4-202ENST00000420482 568 ntTSL 416.51■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 27
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SRSF7Q16629 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.492e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 WDR33-205ENST00000436787 822 ntTSL 510.6□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.862e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 WDR33-202ENST00000393006 3574 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 PTPN4-210ENST00000485247 590 ntTSL 34.16□□□□□ -1.742e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-209ENST00000448962 2384 ntTSL 213.17□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.383e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-210ENST00000460761 644 ntTSL 211.33□□□□□ -0.63e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-206ENST00000436445 752 ntTSL 210.87□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-208ENST00000445961 944 ntTSL 510.86□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-212ENST00000495002 956 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.693e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-211ENST00000484121 897 ntTSL 210.42□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.783e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-224ENST00000636319 2930 ntTSL 515.88■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-214ENST00000626161 706 ntTSL 513.49□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.545e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-219ENST00000630495 759 ntTSL 56.67□□□□□ -1.345e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-212ENST00000625874 3206 ntTSL 26.21□□□□□ -1.425e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.445e-7■■■■■ 26.9
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