RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590275.1

LRP3-202, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene LRP3, Length 1,078 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-202ENST00000590275 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.68■■■■■ 6.02
LRP3-202ENST00000590275 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.8■■■■■ 5.08
LRP3-202ENST00000590275 ABCC9O60706 1549 aa46.32■■■■■ 5.01
LRP3-202ENST00000590275 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.23■■■■■ 4.67
LRP3-202ENST00000590275 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.14■■■■■ 4.66
LRP3-202ENST00000590275 NACADO15069 1562 aa44.13■■■■■ 4.65
LRP3-202ENST00000590275 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
LRP3-202ENST00000590275 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.77■■■■■ 4.6
LRP3-202ENST00000590275 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.49■■■■■ 4.55
LRP3-202ENST00000590275 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.3■■■■■ 4.52
LRP3-202ENST00000590275 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.28■■■■■ 4.52
LRP3-202ENST00000590275 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.11■■■■■ 4.49
LRP3-202ENST00000590275 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43■■■■■ 4.47
LRP3-202ENST00000590275 SCRIBQ14160 1630 aa42.83■■■■■ 4.45
LRP3-202ENST00000590275 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.37■■■■■ 4.37
LRP3-202ENST00000590275 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
LRP3-202ENST00000590275 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.81■■■■■ 4.28
LRP3-202ENST00000590275 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.6■■■■■ 4.25
LRP3-202ENST00000590275 SMARCA4P51532 1647 aa40.9■■■■■ 4.14
LRP3-202ENST00000590275 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.83■■■■■ 4.13
LRP3-202ENST00000590275 NCAPD3P42695 1498 aa40.82■■■■■ 4.12
LRP3-202ENST00000590275 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
LRP3-202ENST00000590275 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.67■■■■■ 4.1
LRP3-202ENST00000590275 SMARCA2P51531 1590 aa40.61■■■■■ 4.09
LRP3-202ENST00000590275 HMGXB3Q12766 1538 aa40.52■■■■■ 4.08
LRP3-202ENST00000590275 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.5■■■■■ 4.07
LRP3-202ENST00000590275 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
LRP3-202ENST00000590275 WIZO95785 1651 aa40.16■■■■■ 4.02
LRP3-202ENST00000590275 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
LRP3-202ENST00000590275 NESP48681 1621 aa40.05■■■■■ 4
LRP3-202ENST00000590275 ERCC6Q03468 1493 aa39.81■■■■□ 3.96
LRP3-202ENST00000590275 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.68■■■■□ 3.94
LRP3-202ENST00000590275 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
LRP3-202ENST00000590275 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.61■■■■□ 3.93
LRP3-202ENST00000590275 CUX2O14529 1486 aa39.49■■■■□ 3.91
LRP3-202ENST00000590275 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.45■■■■□ 3.91
LRP3-202ENST00000590275 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.41■■■■□ 3.9
LRP3-202ENST00000590275 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
LRP3-202ENST00000590275 CFTRP13569 1480 aa39.32■■■■□ 3.89
LRP3-202ENST00000590275 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.29■■■■□ 3.88
LRP3-202ENST00000590275 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.15■■■■□ 3.86
LRP3-202ENST00000590275 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.11■■■■□ 3.85
LRP3-202ENST00000590275 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.07■■■■□ 3.85
LRP3-202ENST00000590275 WDR62O43379 1518 aa39■■■■□ 3.83
LRP3-202ENST00000590275 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
LRP3-202ENST00000590275 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.8
LRP3-202ENST00000590275 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.78■■■■□ 3.8
LRP3-202ENST00000590275 PRDM2Q13029 1718 aa38.77■■■■□ 3.8
LRP3-202ENST00000590275 TOPBP1Q92547 1522 aa38.51■■■■□ 3.76
LRP3-202ENST00000590275 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.37■■■■□ 3.73
LRP3-202ENST00000590275 ABCC8Q09428 1581 aa38.31■■■■□ 3.72
LRP3-202ENST00000590275 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
LRP3-202ENST00000590275 IFT140Q96RY7 1462 aa38.28■■■■□ 3.72
LRP3-202ENST00000590275 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.17■■■■□ 3.7
LRP3-202ENST00000590275 CUX1P39880 1505 aa38.16■■■■□ 3.7
LRP3-202ENST00000590275 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
LRP3-202ENST00000590275 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.09■■■■□ 3.69
LRP3-202ENST00000590275 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.03■■■■□ 3.68
LRP3-202ENST00000590275 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.01■■■■□ 3.67
LRP3-202ENST00000590275 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
LRP3-202ENST00000590275 SOGA1O94964 1423 aa37.99■■■■□ 3.67
LRP3-202ENST00000590275 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
LRP3-202ENST00000590275 OSCARQ8IYS5 282 aa37.84■■■■□ 3.65
LRP3-202ENST00000590275 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.71■■■■□ 3.63
LRP3-202ENST00000590275 SYNJ1O43426 1573 aa37.71■■■■□ 3.63
LRP3-202ENST00000590275 WDR97A6NE52 1622 aa37.67■■■■□ 3.62
LRP3-202ENST00000590275 TOP2BQ02880 1626 aa37.64■■■■□ 3.62
LRP3-202ENST00000590275 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.61■■■■□ 3.61
LRP3-202ENST00000590275 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.61■■■■□ 3.61
LRP3-202ENST00000590275 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.59■■■■□ 3.61
LRP3-202ENST00000590275 GRIN2BQ13224 1484 aa37.53■■■■□ 3.6
LRP3-202ENST00000590275 CHD1O14646 1710 aa37.53■■■■□ 3.6
LRP3-202ENST00000590275 FBLN2P98095 1184 aa37.52■■■■□ 3.6
LRP3-202ENST00000590275 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.52■■■■□ 3.6
LRP3-202ENST00000590275 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.49■■■■□ 3.59
LRP3-202ENST00000590275 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
LRP3-202ENST00000590275 PBRM1Q86U86 1689 aa37.37■■■■□ 3.57
LRP3-202ENST00000590275 TRIM41Q8WV44 630 aa37.36■■■■□ 3.57
LRP3-202ENST00000590275 SYNJ2O15056 1496 aa37.33■■■■□ 3.57
LRP3-202ENST00000590275 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
LRP3-202ENST00000590275 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.3■■■■□ 3.56
LRP3-202ENST00000590275 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.3■■■■□ 3.56
LRP3-202ENST00000590275 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.3■■■■□ 3.56
LRP3-202ENST00000590275 ARHGEF11O15085 1522 aa37.27■■■■□ 3.56
LRP3-202ENST00000590275 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.2■■■■□ 3.55
LRP3-202ENST00000590275 ADAMTS12P58397 1594 aa37.15■■■■□ 3.54
LRP3-202ENST00000590275 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.1■■■■□ 3.53
LRP3-202ENST00000590275 GRIN2AQ12879 1464 aa37.08■■■■□ 3.53
LRP3-202ENST00000590275 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.06■■■■□ 3.52
LRP3-202ENST00000590275 ARAP1Q96P48 1450 aa37.01■■■■□ 3.52
LRP3-202ENST00000590275 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.98■■■■□ 3.51
LRP3-202ENST00000590275 NUP160Q12769 1436 aa36.97■■■■□ 3.51
LRP3-202ENST00000590275 CEP170Q5SW79 1584 aa36.96■■■■□ 3.51
LRP3-202ENST00000590275 IGF1RP08069 1367 aa36.93■■■■□ 3.5
LRP3-202ENST00000590275 KIF27Q86VH2 1401 aa36.9■■■■□ 3.5
LRP3-202ENST00000590275 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.78■■■■□ 3.48
LRP3-202ENST00000590275 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.7■■■■□ 3.47
LRP3-202ENST00000590275 SHROOM2Q13796 1616 aa36.67■■■■□ 3.46
LRP3-202ENST00000590275 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.64■■■■□ 3.46
LRP3-202ENST00000590275 CUL7Q14999 1698 aa36.63■■■■□ 3.45
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