RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.49■■■■□ 3.43
LRP3-201ENST00000253193 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.39■■■□□ 2.78
LRP3-201ENST00000253193 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
LRP3-201ENST00000253193 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.97■■■□□ 2.71
LRP3-201ENST00000253193 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
LRP3-201ENST00000253193 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.57■■■□□ 2.48
LRP3-201ENST00000253193 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.41■■■□□ 2.46
LRP3-201ENST00000253193 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.31■■■□□ 2.44
LRP3-201ENST00000253193 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.24■■■□□ 2.43
LRP3-201ENST00000253193 HRCP23327 699 aa30.16■■■□□ 2.42
LRP3-201ENST00000253193 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.04■■■□□ 2.4
LRP3-201ENST00000253193 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
LRP3-201ENST00000253193 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.87■■■□□ 2.37
LRP3-201ENST00000253193 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
LRP3-201ENST00000253193 TRIM41Q8WV44 630 aa29.62■■■□□ 2.33
LRP3-201ENST00000253193 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.47■■■□□ 2.31
LRP3-201ENST00000253193 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
LRP3-201ENST00000253193 SCRIBQ14160 1630 aa29.32■■■□□ 2.28
LRP3-201ENST00000253193 ABCC9O60706 1549 aa29.23■■■□□ 2.27
LRP3-201ENST00000253193 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
LRP3-201ENST00000253193 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
LRP3-201ENST00000253193 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
LRP3-201ENST00000253193 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.73■■■□□ 2.19
LRP3-201ENST00000253193 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.72■■■□□ 2.19
LRP3-201ENST00000253193 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
LRP3-201ENST00000253193 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.5■■■□□ 2.15
LRP3-201ENST00000253193 NACADO15069 1562 aa28.47■■■□□ 2.15
LRP3-201ENST00000253193 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
LRP3-201ENST00000253193 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
LRP3-201ENST00000253193 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.14
LRP3-201ENST00000253193 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
LRP3-201ENST00000253193 WIZO95785 1651 aa28.26■■■□□ 2.12
LRP3-201ENST00000253193 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
LRP3-201ENST00000253193 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
LRP3-201ENST00000253193 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.02■■■□□ 2.08
LRP3-201ENST00000253193 APLP2Q06481 763 aa27.97■■■□□ 2.07
LRP3-201ENST00000253193 ABCC8Q09428 1581 aa27.95■■■□□ 2.06
LRP3-201ENST00000253193 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.91■■■□□ 2.06
LRP3-201ENST00000253193 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
LRP3-201ENST00000253193 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
LRP3-201ENST00000253193 SOGA1O94964 1423 aa27.87■■■□□ 2.05
LRP3-201ENST00000253193 NEUROD1Q13562 356 aa27.81■■■□□ 2.04
LRP3-201ENST00000253193 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
LRP3-201ENST00000253193 CEP162Q5TB80 1403 aa27.81■■■□□ 2.04
LRP3-201ENST00000253193 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
LRP3-201ENST00000253193 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
LRP3-201ENST00000253193 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
LRP3-201ENST00000253193 SMARCA4P51532 1647 aa27.65■■■□□ 2.02
LRP3-201ENST00000253193 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
LRP3-201ENST00000253193 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.64■■■□□ 2.02
LRP3-201ENST00000253193 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.62■■■□□ 2.01
LRP3-201ENST00000253193 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.6■■■□□ 2.01
LRP3-201ENST00000253193 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.58■■■□□ 2
LRP3-201ENST00000253193 SMARCA2P51531 1590 aa27.55■■■□□ 2
LRP3-201ENST00000253193 EEA1Q15075 1411 aa27.5■■□□□ 1.99
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA3Q08378 1498 aa27.48■■□□□ 1.99
LRP3-201ENST00000253193 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
LRP3-201ENST00000253193 CLIP1P30622 1438 aa27.38■■□□□ 1.97
LRP3-201ENST00000253193 ITGAEP38570 1179 aa27.33■■□□□ 1.97
LRP3-201ENST00000253193 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
LRP3-201ENST00000253193 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
LRP3-201ENST00000253193 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.27■■□□□ 1.96
LRP3-201ENST00000253193 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
LRP3-201ENST00000253193 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.15■■□□□ 1.94
LRP3-201ENST00000253193 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.13■■□□□ 1.93
LRP3-201ENST00000253193 MIER1Q8N108 512 aa27.1■■□□□ 1.93
LRP3-201ENST00000253193 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.09■■□□□ 1.93
LRP3-201ENST00000253193 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.05■■□□□ 1.92
LRP3-201ENST00000253193 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.05■■□□□ 1.92
LRP3-201ENST00000253193 SYNJ1O43426 1573 aa27.04■■□□□ 1.92
LRP3-201ENST00000253193 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
LRP3-201ENST00000253193 P3H3Q8IVL6 736 aa26.88■■□□□ 1.89
LRP3-201ENST00000253193 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
LRP3-201ENST00000253193 KIF27Q86VH2 1401 aa26.78■■□□□ 1.88
LRP3-201ENST00000253193 KIF21BO75037 1637 aa26.77■■□□□ 1.88
LRP3-201ENST00000253193 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.74■■□□□ 1.87
LRP3-201ENST00000253193 TOP2BQ02880 1626 aa26.57■■□□□ 1.84
LRP3-201ENST00000253193 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
LRP3-201ENST00000253193 CUX2O14529 1486 aa26.55■■□□□ 1.84
LRP3-201ENST00000253193 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.55■■□□□ 1.84
LRP3-201ENST00000253193 ARAP1Q96P48 1450 aa26.52■■□□□ 1.84
LRP3-201ENST00000253193 PRXQ9BXM0 1461 aa26.52■■□□□ 1.84
LRP3-201ENST00000253193 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.51■■□□□ 1.83
LRP3-201ENST00000253193 NCAPD3P42695 1498 aa26.49■■□□□ 1.83
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LRP3-201ENST00000253193 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.46■■□□□ 1.83
LRP3-201ENST00000253193 CUX1P39880 1505 aa26.46■■□□□ 1.83
LRP3-201ENST00000253193 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.41■■□□□ 1.82
LRP3-201ENST00000253193 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
LRP3-201ENST00000253193 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
LRP3-201ENST00000253193 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.38■■□□□ 1.81
LRP3-201ENST00000253193 IGF1RP08069 1367 aa26.37■■□□□ 1.81
LRP3-201ENST00000253193 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.35■■□□□ 1.81
LRP3-201ENST00000253193 CFTRP13569 1480 aa26.34■■□□□ 1.81
LRP3-201ENST00000253193 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.33■■□□□ 1.81
LRP3-201ENST00000253193 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
LRP3-201ENST00000253193 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.32■■□□□ 1.8
LRP3-201ENST00000253193 BCANQ96GW7 911 aa26.29■■□□□ 1.8
LRP3-201ENST00000253193 KCNH8Q96L42 1107 aa26.26■■□□□ 1.79
LRP3-201ENST00000253193 HMGXB3Q12766 1538 aa26.25■■□□□ 1.79
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