RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429400.6

MLXIPL-205, Transcript of MLX interacting protein like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MLXIPL, Length 3,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLXIPL-205ENST00000429400 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.51■■■□□ 2.31
MLXIPL-205ENST00000429400 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.45■■□□□ 1.83
MLXIPL-205ENST00000429400 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.1■■□□□ 1.77
MLXIPL-205ENST00000429400 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
MLXIPL-205ENST00000429400 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
MLXIPL-205ENST00000429400 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.66■■□□□ 1.54
MLXIPL-205ENST00000429400 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.52■■□□□ 1.52
MLXIPL-205ENST00000429400 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.5■■□□□ 1.51
MLXIPL-205ENST00000429400 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.48■■□□□ 1.51
MLXIPL-205ENST00000429400 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.45■■□□□ 1.5
MLXIPL-205ENST00000429400 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.4■■□□□ 1.5
MLXIPL-205ENST00000429400 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
MLXIPL-205ENST00000429400 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
MLXIPL-205ENST00000429400 ABCC9O60706 1549 aa23.97■■□□□ 1.43
MLXIPL-205ENST00000429400 SCRIBQ14160 1630 aa23.91■■□□□ 1.42
MLXIPL-205ENST00000429400 HRCP23327 699 aa23.84■■□□□ 1.41
MLXIPL-205ENST00000429400 TRIM41Q8WV44 630 aa23.83■■□□□ 1.41
MLXIPL-205ENST00000429400 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.6■■□□□ 1.37
MLXIPL-205ENST00000429400 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
MLXIPL-205ENST00000429400 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
MLXIPL-205ENST00000429400 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.47■■□□□ 1.35
MLXIPL-205ENST00000429400 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
MLXIPL-205ENST00000429400 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.37■■□□□ 1.33
MLXIPL-205ENST00000429400 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.332e-9■■■■■ 30.4
MLXIPL-205ENST00000429400 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.2■■□□□ 1.3
MLXIPL-205ENST00000429400 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
MLXIPL-205ENST00000429400 WIZO95785 1651 aa23.07■■□□□ 1.28
MLXIPL-205ENST00000429400 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
MLXIPL-205ENST00000429400 NACADO15069 1562 aa22.93■■□□□ 1.26
MLXIPL-205ENST00000429400 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
MLXIPL-205ENST00000429400 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
MLXIPL-205ENST00000429400 ABCC8Q09428 1581 aa22.8■■□□□ 1.24
MLXIPL-205ENST00000429400 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.68■■□□□ 1.22
MLXIPL-205ENST00000429400 SOGA1O94964 1423 aa22.65■■□□□ 1.22
MLXIPL-205ENST00000429400 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
MLXIPL-205ENST00000429400 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
MLXIPL-205ENST00000429400 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.58■■□□□ 1.21
MLXIPL-205ENST00000429400 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
MLXIPL-205ENST00000429400 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.53■■□□□ 1.2
MLXIPL-205ENST00000429400 SMARCA4P51532 1647 aa22.42■■□□□ 1.18
MLXIPL-205ENST00000429400 CEP162Q5TB80 1403 aa22.38■■□□□ 1.17
MLXIPL-205ENST00000429400 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
MLXIPL-205ENST00000429400 SMARCA2P51531 1590 aa22.35■■□□□ 1.17
MLXIPL-205ENST00000429400 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.32■■□□□ 1.16
MLXIPL-205ENST00000429400 APLP2Q06481 763 aa22.26■■□□□ 1.15
MLXIPL-205ENST00000429400 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
MLXIPL-205ENST00000429400 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
MLXIPL-205ENST00000429400 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
MLXIPL-205ENST00000429400 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
MLXIPL-205ENST00000429400 ITGAEP38570 1179 aa22.18■■□□□ 1.14
MLXIPL-205ENST00000429400 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
MLXIPL-205ENST00000429400 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.14■■□□□ 1.13
MLXIPL-205ENST00000429400 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.13■■□□□ 1.13
MLXIPL-205ENST00000429400 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
MLXIPL-205ENST00000429400 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
MLXIPL-205ENST00000429400 NEUROD1Q13562 356 aa22.05■■□□□ 1.12
MLXIPL-205ENST00000429400 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.02■■□□□ 1.12
MLXIPL-205ENST00000429400 GOLGA3Q08378 1498 aa22.01■■□□□ 1.11
MLXIPL-205ENST00000429400 CLIP1P30622 1438 aa22■■□□□ 1.11
MLXIPL-205ENST00000429400 SYNJ1O43426 1573 aa22■■□□□ 1.11
MLXIPL-205ENST00000429400 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.97■■□□□ 1.11
MLXIPL-205ENST00000429400 P3H3Q8IVL6 736 aa21.94■■□□□ 1.1
MLXIPL-205ENST00000429400 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
MLXIPL-205ENST00000429400 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.89■■□□□ 1.09
MLXIPL-205ENST00000429400 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
MLXIPL-205ENST00000429400 EEA1Q15075 1411 aa21.84■■□□□ 1.09
MLXIPL-205ENST00000429400 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.84■■□□□ 1.09
MLXIPL-205ENST00000429400 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
MLXIPL-205ENST00000429400 MIER1Q8N108 512 aa21.8■■□□□ 1.08
MLXIPL-205ENST00000429400 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
MLXIPL-205ENST00000429400 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.69■■□□□ 1.06
MLXIPL-205ENST00000429400 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
MLXIPL-205ENST00000429400 KIF21BO75037 1637 aa21.59■■□□□ 1.05
MLXIPL-205ENST00000429400 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.57■■□□□ 1.04
MLXIPL-205ENST00000429400 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
MLXIPL-205ENST00000429400 ARID3CA6NKF2 412 aa21.53■■□□□ 1.04
MLXIPL-205ENST00000429400 CUX1P39880 1505 aa21.51■■□□□ 1.03
MLXIPL-205ENST00000429400 KIF27Q86VH2 1401 aa21.5■■□□□ 1.03
MLXIPL-205ENST00000429400 ARAP1Q96P48 1450 aa21.49■■□□□ 1.03
MLXIPL-205ENST00000429400 CUX2O14529 1486 aa21.49■■□□□ 1.03
MLXIPL-205ENST00000429400 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.48■■□□□ 1.03
MLXIPL-205ENST00000429400 TOP2BQ02880 1626 aa21.46■■□□□ 1.03
MLXIPL-205ENST00000429400 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.42■■□□□ 1.02
MLXIPL-205ENST00000429400 NCAPD3P42695 1498 aa21.39■■□□□ 1.02
MLXIPL-205ENST00000429400 PRXQ9BXM0 1461 aa21.38■■□□□ 1.01
MLXIPL-205ENST00000429400 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
MLXIPL-205ENST00000429400 IGF1RP08069 1367 aa21.35■■□□□ 1.01
MLXIPL-205ENST00000429400 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.34■■□□□ 1.01
MLXIPL-205ENST00000429400 KCNH8Q96L42 1107 aa21.34■■□□□ 1.01
MLXIPL-205ENST00000429400 CFTRP13569 1480 aa21.3■■□□□ 1
MLXIPL-205ENST00000429400 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.3■■□□□ 1
MLXIPL-205ENST00000429400 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.3■■□□□ 1
MLXIPL-205ENST00000429400 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.29■■□□□ 1
MLXIPL-205ENST00000429400 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.28■■□□□ 1
MLXIPL-205ENST00000429400 NESP48681 1621 aa21.28■■□□□ 1
MLXIPL-205ENST00000429400 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.24■□□□□ 0.99
MLXIPL-205ENST00000429400 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
MLXIPL-205ENST00000429400 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.22■□□□□ 0.99
MLXIPL-205ENST00000429400 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
MLXIPL-205ENST00000429400 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms