Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11BQ15907 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11BQ15907 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11BQ15907 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11BQ15907 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11BQ15907 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11BQ15907 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11BQ15907 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11BQ15907 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11BQ15907 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11BQ15907 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11BQ15907 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11BQ15907 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11BQ15907 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11BQ15907 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11BQ15907 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11BQ15907 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11BQ15907 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11BQ15907 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11BQ15907 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11BQ15907 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11BQ15907 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11BQ15907 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms