Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP6AP1Q15904 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6AP1Q15904 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6AP1Q15904 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6AP1Q15904 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6AP1Q15904 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6AP1Q15904 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6AP1Q15904 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP6AP1Q15904 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP6AP1Q15904 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6AP1Q15904 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6AP1Q15904 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6AP1Q15904 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6AP1Q15904 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6AP1Q15904 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6AP1Q15904 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6AP1Q15904 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6AP1Q15904 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6AP1Q15904 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6AP1Q15904 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6AP1Q15904 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6AP1Q15904 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6AP1Q15904 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6AP1Q15904 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6AP1Q15904 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6AP1Q15904 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6AP1Q15904 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6AP1Q15904 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6AP1Q15904 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP6AP1Q15904 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6AP1Q15904 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6AP1Q15904 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6AP1Q15904 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6AP1Q15904 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6AP1Q15904 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6AP1Q15904 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6AP1Q15904 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6AP1Q15904 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6AP1Q15904 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6AP1Q15904 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6AP1Q15904 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6AP1Q15904 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6AP1Q15904 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6AP1Q15904 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6AP1Q15904 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6AP1Q15904 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6AP1Q15904 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6AP1Q15904 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP6AP1Q15904 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP6AP1Q15904 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP6AP1Q15904 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP6AP1Q15904 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP6AP1Q15904 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP6AP1Q15904 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP6AP1Q15904 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP6AP1Q15904 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP6AP1Q15904 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6AP1Q15904 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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