Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC1A5Q15758 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC1A5Q15758 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC1A5Q15758 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC1A5Q15758 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC1A5Q15758 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC1A5Q15758 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC1A5Q15758 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC1A5Q15758 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC1A5Q15758 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC1A5Q15758 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC1A5Q15758 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC1A5Q15758 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC1A5Q15758 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A5Q15758 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A5Q15758 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms