Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SS18Q15532 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SS18Q15532 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SS18Q15532 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SS18Q15532 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SS18Q15532 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SS18Q15532 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SS18Q15532 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SS18Q15532 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SS18Q15532 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SS18Q15532 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SS18Q15532 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SS18Q15532 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SS18Q15532 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SS18Q15532 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SS18Q15532 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SS18Q15532 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SS18Q15532 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SS18Q15532 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SS18Q15532 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SS18Q15532 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SS18Q15532 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SS18Q15532 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SS18Q15532 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SS18Q15532 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SS18Q15532 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SS18Q15532 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SS18Q15532 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SS18Q15532 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SS18Q15532 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SS18Q15532 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SS18Q15532 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SS18Q15532 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SS18Q15532 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SS18Q15532 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SS18Q15532 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SS18Q15532 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SS18Q15532 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SS18Q15532 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SS18Q15532 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SS18Q15532 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SS18Q15532 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SS18Q15532 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SS18Q15532 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SS18Q15532 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SS18Q15532 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SS18Q15532 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SS18Q15532 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SS18Q15532 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SS18Q15532 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SS18Q15532 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SS18Q15532 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SS18Q15532 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SS18Q15532 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SS18Q15532 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SS18Q15532 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18Q15532 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18Q15532 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18Q15532 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18Q15532 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18Q15532 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18Q15532 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18Q15532 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18Q15532 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18Q15532 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18Q15532 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18Q15532 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18Q15532 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18Q15532 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18Q15532 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18Q15532 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18Q15532 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18Q15532 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18Q15532 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18Q15532 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18Q15532 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18Q15532 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18Q15532 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18Q15532 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18Q15532 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18Q15532 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18Q15532 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18Q15532 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18Q15532 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18Q15532 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18Q15532 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SS18Q15532 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SS18Q15532 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SS18Q15532 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18Q15532 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18Q15532 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18Q15532 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18Q15532 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18Q15532 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SS18Q15532 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SS18Q15532 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SS18Q15532 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SS18Q15532 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SS18Q15532 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SS18Q15532 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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