Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MELKQ14680 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MELKQ14680 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MELKQ14680 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MELKQ14680 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MELKQ14680 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MELKQ14680 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MELKQ14680 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MELKQ14680 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MELKQ14680 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MELKQ14680 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MELKQ14680 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MELKQ14680 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MELKQ14680 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MELKQ14680 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MELKQ14680 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MELKQ14680 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MELKQ14680 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MELKQ14680 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MELKQ14680 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MELKQ14680 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MELKQ14680 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MELKQ14680 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MELKQ14680 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MELKQ14680 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MELKQ14680 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MELKQ14680 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MELKQ14680 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MELKQ14680 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MELKQ14680 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MELKQ14680 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MELKQ14680 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MELKQ14680 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MELKQ14680 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MELKQ14680 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MELKQ14680 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MELKQ14680 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MELKQ14680 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MELKQ14680 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MELKQ14680 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MELKQ14680 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MELKQ14680 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MELKQ14680 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MELKQ14680 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MELKQ14680 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MELKQ14680 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MELKQ14680 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MELKQ14680 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MELKQ14680 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MELKQ14680 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MELKQ14680 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MELKQ14680 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MELKQ14680 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MELKQ14680 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MELKQ14680 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MELKQ14680 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MELKQ14680 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MELKQ14680 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MELKQ14680 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MELKQ14680 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MELKQ14680 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MELKQ14680 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MELKQ14680 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MELKQ14680 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MELKQ14680 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MELKQ14680 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MELKQ14680 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MELKQ14680 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MELKQ14680 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MELKQ14680 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MELKQ14680 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MELKQ14680 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MELKQ14680 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MELKQ14680 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MELKQ14680 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MELKQ14680 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MELKQ14680 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MELKQ14680 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MELKQ14680 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MELKQ14680 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MELKQ14680 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MELKQ14680 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MELKQ14680 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MELKQ14680 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MELKQ14680 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MELKQ14680 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MELKQ14680 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MELKQ14680 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MELKQ14680 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MELKQ14680 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MELKQ14680 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MELKQ14680 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MELKQ14680 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MELKQ14680 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MELKQ14680 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MELKQ14680 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MELKQ14680 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MELKQ14680 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MELKQ14680 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MELKQ14680 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms