Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3AQ14563 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3AQ14563 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3AQ14563 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3AQ14563 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3AQ14563 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3AQ14563 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3AQ14563 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3AQ14563 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3AQ14563 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3AQ14563 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3AQ14563 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3AQ14563 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3AQ14563 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3AQ14563 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3AQ14563 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3AQ14563 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SEMA3AQ14563 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEMA3AQ14563 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3AQ14563 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3AQ14563 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3AQ14563 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3AQ14563 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3AQ14563 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3AQ14563 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3AQ14563 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3AQ14563 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3AQ14563 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3AQ14563 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
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