Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBA3CQ13748 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBA3CQ13748 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA3CQ13748 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA3CQ13748 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA3CQ13748 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA3CQ13748 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA3CQ13748 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBA3CQ13748 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBA3CQ13748 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBA3CQ13748 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBA3CQ13748 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBA3CQ13748 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBA3CQ13748 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA3CQ13748 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBA3CQ13748 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA3CQ13748 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA3CQ13748 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA3CQ13748 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA3CQ13748 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
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